Voor de tweede generatie van het Programma Steunpunten voor Beleidsrelevant Onderzoek legde de Vlaamse Regering 14 thema's vast waarvoor telkens één steunpunt werd erkend. De bepaling van deze thema's werd gestoeld op de beleidsdomeinen van de Vlaamse overheid.

Bij het bepalen van de onderzoeksagenda bleek echter dat sommige onderzoeksdomeinen moeilijk in één organisatorisch geheel te combineren waren. Daarom werden twee steunpunten elk opgesplitst in twee onderzoekssporen, maar binnen één beheersovereenkomst.

Het Steunpunt Mobiliteit en Openbare Werken omvat het spoor Goederenstromen en het spoor Verkeersveiligheid. Het Steunpunt Buitenlands beleid, Toerisme en Recreatie omvat het spoor Buitenlands Beleid en het spoor Toerisme en Recreatie.

Formeel zijn dus 14 steunpunten erkend, waarvan er twee in twee sporen werden opgedeeld. In de praktijk worden deze sporen als steunpunten behandeld wat het aantal zo op 16 brengt.

De reserve-regeling is vervat in art. 31 van de beheersovereenkomst die met ieder steunpunt werd afgesloten.

Het steunpunt mag in het eerste werkingsjaar (2007) 40% van de in 2007 toegekende financiering overdragen naar het volgende werkingsjaar (2008). Vanaf het tweede werkingsjaar mag nog 20% van de in dat jaar toegekende financiering overgedragen worden.

Voorbeeld: bij het jaarverslag 2007 blijkt dat een steunpunt van de totale financiering 2007, in dit voorbeeld, € 100 slechts € 60 heeft besteed. Het steunpunt kan dan de resterende € 40 (dat binnen de 40% reservemarge valt) overdragen naar het jaar 2008. Indien het reserende bedrag hoger is dan € 40, wordt het bedrag waarmee de reservemarge overstegen wordt in mindering gebracht op de financiering 2007. Indien het steunpunt slechts € 50 besteedde, bedraagt de overdracht naar 2008 € 40 en ontvangt het steunpunt voor het werkingsjaar 2007 slechts € 90 in plaats van € 100.

De reserve wordt enkel overgedragen naar het volgende jaar. Indien bij een jaarlijkse totale financiering van € 100, er in 2008 een reserve is van € 20 wordt deze naar 2009 overgedragen. Deze reserve kan niet opgespaard worden om dan pas in 2010 te gebruiken. Met de reserveoverdracht naar 2009 en de jaarlijkse financiering heeft het steunpunt € 120 ter beschikking. Om geen middelen te verliezen zal het steunpunt in 2009 € 100 moeten besteden en kan dan maximaal € 20 overdragen naar 2010.

Art. 28 van de beheersovereenkomst geeft een overzicht van de financiering (basisfinanciering en cofinancieirng) die het steunpunt ontvangt en de basisallocaties waarop deze middelen worden uitbetaald.

De basisfinanciering wordt door het Departement Economie, Wetenschap en Innovatie geregeld (PR 71.4 BA 33.03), de cofinanciering door de functioneel bevoegde beleidsdomeinen.

De uitbetaling gebeurt volgens art. 5 van het besluit van de Vlaamse Regering van 15 september 2006 betreffende de Steunpunten voor Beleidsrelevant Onderzoek.

. Een eerste schijf van 40% van de jaarlijkse financiering wordt door de betrokken beleidsdomeinen, ten laatste op 31 januari van het werkingsjaar uitbetaald.

. De tweede schijf van 30% van de jaarlijkse financiering wordt door de betrokken beleidsdomeinen, ten laatste op 30 juni van het werkingsjaar uitbetaald

. Het saldo, de derde schijf, wordt na goedkeuring van het werkings- en activiteitenverslag uitbetaald door de betrokken beleidsdomeinen. Hierop wordt bijvoorbeeld de overschrijding van de reservemarge in mindering gebracht. Het werkings- en activiteitenverslag wordt in de beheersovereenkomst, art. 21 - 23, geregeld.

Het steunpunt ontvangt de laatste schijf voor het werkingsjaar 2007 pas in 2008 na de goedkeuring van het werkings- en activiteitenverslag van het jaar 2007. Ondertussen ontvangt het steunpunt wel de eerste schijf van het jaar 2008.

Overeenkomstig art. 29 van de beheersovereenkomst worden deze middelen aan de Penvoerder van het steunpunt uitbetaald. De Penvoerder betaalt vervolgens, conform de modaliteiten van de samenwerkingsovereenkomst, de ontvangen financiering uit aan de overige Initiatoren.

De in art. 28 van de beheersovereenkomst vermelde basisallocaties werden naar aanleiding van de herstructurering van de Vlaamse overheid "Beter Bestuurlijk Beleid" gewijzigd. Hierbij een overzicht van de oude en nieuwe referenties.

. Basisfinanciering:

. Cofinanciering:

Steunpunt Bestuurlijke Organisatie Vlaanderen

Steunpunt Buitenlands beleid, Toerisme en Recreatie, Spoor Buitenlands beleid

Steunpunt Buitenlands beleid, Toerisme en Recreatie, Spoor Toerisme en Recreatie

Steunpunt Cultuur, Jeugd en Sport

Steunpunt Duurzame Ontwikkeling

Steunpunt Fiscaliteit en Begroting

Steunpunt Gelijkekansenbeleid

Steunpunt Milieu en Gezondheid

Steunpunt Mobiliteit en Openbare Werken, Spoor Verkeersveiligheid

Steunpunt O&O indicatoren

Steunpunt Ondernemen en Internationaal Ondernemen

Steunpunt Ruimte en Wonen

Steunpunt Studie en Schoolloopbanen

Steunpunt Welzijn, Volksgezondheid en Gezin

Het werkings- en activiteitenverslag wordt in de beheersovereenkomst, art. 21 - 23, geregeld, het jaarplan en de begroting in art. 16 - 20.

Het jaarplan en de begroting worden opgesteld aan de hand van een sjabloon. Om de vergelijking van het jaarplan met het werkings- en activiteitenverslag te vergemakkelijken, is ook voor het verslag een sjabloon met eenzelfde structuur opgesteld.

Sjabloon Jaarplan - Sjabloon Begroting

Sjabloon Werkings- en activiteitenverslag - Sjabloon Jaarrekening

Omwille van een heel aantal verschillende factoren of omstandigheden kunnen de inhoudelijke doelstellingen wijzigen of kan er een noodzaak ontstaan om de doelstellingen te wijzigen. Afhankelijk van de effect van de wijziging wordt deze anders geformaliseerd.

. Wijzigingen met een beperkt effect, zoals het niet halen van een deadline tijdens een werkingsjaar, wordt in eerste instantie aan de stuurgroep gemeld en geformaliseerd in het jaarverslag.

. Voor wijzigingen met een iets groter effect maar die slechts effect hebben op één jaar kan het jaarplan aangepast worden. Het steunpunt stelt hiervoor een nieuw jaarplan op dat opnieuw door de stuurgroep en de minister wordt goedgekeurd en dat het oude jaarplan vervangt. Het tijdstip van deze wijziging speelt natuurlijk ook een rol. Het heeft weinig zin een wijziging van jaarplan door te voeren in december van het betreffende jaar.

. Wijzigingen die een effect hebben op meerdere jaren worden best geregeld via een aanpassing van het meerjarenplan. Omdat het meerjarenplan deel uitmaakt van de beheersovereenkomst dient men de procedure voor wijziging van de beheersovereenkomst te volgen.

. Wijzigingen waarbij het bijkomende onderzoek gaat doen en waar bijkomende financiering voor voorzien is, worden ook via een wijziging van de beheersovereenkomst geregeld. De financiering van het steunpunt is immers geregeld in art. 28 van de beheersovereenkomst.